Las pruebas de aplicaciones móviles son muy diferentes y difíciles, entonces las pruebas regulares de sitios web o aplicaciones web basadas en escritorio. Hay muchas razones por las que una aplicación tiene errores incluso después de someterse a muchos ciclos de prueba.
Hay varias razones que se combinan para representar un gran desafío para el probador de aplicaciones móviles.
1. No. de dispositivos móviles: el mercado móvil está en constante aumento y evolución. Casi todos a tu alrededor llevan uno. Se han enviado alrededor de 700 millones de dispositivos Android después de Android 1.0 y alrededor de 500 millones de dispositivos iOS, desde que Apple comenzó a enviar iPhones. Estos dispositivos se pueden clasificar en función de la disponibilidad, desde teléfonos, teléfonos inteligentes, pestañas, ipads y tecnología portátil, proporcionando una gran diversidad de entornos a los que se enfrenta su aplicación móvil.
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Además, el equipo de calidad no puede garantizar que si una aplicación probada funciona bien en un dispositivo dado, funcionará al 100% en otro dispositivo incluso si es de la misma familia de productos porque la resolución de la pantalla, la CPU, la memoria, la optimización del sistema operativo y el hardware podrían ser diferentes .
2. Fragmentación de dispositivos y sistemas operativos: este es el aspecto más desafiante de la matriz de pruebas móviles. Aunque la matriz de dispositivos iOS está creciendo más que nunca, la fragmentación es especialmente un problema para el sistema operativo Android.
Si le preocupa la calidad en las aplicaciones multiplataforma, encontrará una matriz igualmente complicada. Aunque menos desalentador que la matriz de hardware, la variedad de sistemas operativos móviles también plantea un desafío para los equipos de ingeniería cuyo objetivo es proporcionar una experiencia de usuario coherente en todas las plataformas. 
3. Problemas de compatibilidad: las pruebas de aplicaciones móviles también son un desafío, debido a problemas de compatibilidad, ya que una aplicación móvil se puede implementar en dispositivos que tienen diferentes
- Sistemas operativos como iOS, Android, Blackberry, Windows, etc.
- Versiones de un sistema operativo como iOS 4.X, iOS 5.X, BB 4.X, 5.X y 6.X.
4. Tipos de aplicaciones : una aplicación móvil puede ser una aplicación nativa, una aplicación web o una aplicación híbrida que tiene ambos contenidos. La prueba de cada tipo de aplicación es diferente a otra, ya que su implementación es bastante diferente entre sí. 
5. Entorno de prueba : los emuladores y simuladores móviles nos permiten verificar la funcionalidad general y realizar pruebas de regresión. Pero tienen un alcance muy limitado y nunca deben considerarse un sustituto del mundo real.
El uso de emuladores y simuladores en conjunto con pruebas en la naturaleza le dará los mejores resultados.
6. No dando suficiente importancia : Según el Informe de calidad de Cap Gemini (Pruebas móviles), el 18% de las empresas que respondieron dicen que no tienen suficiente tiempo para probar aplicaciones móviles, y el 65% no tienen las herramientas adecuadas. También el 52% cita la falta de dispositivos como una razón para no hacer pruebas móviles. 
